Існує чотири шляхи потрапляння наночастинок в організм людини: вдихання, ковтання, всмоктування з шкіри або навмисне введення (або вивільнення з імплантатів) під час медичних процедур. Потрапляючи в організм людини, вони мають високий ступінь рухливості. У деяких випадках вони навіть можуть перетнути гематоенцефалічний бар’єр.
Поведінка наночастинок в органах все ще залишається важливим предметом для вивчення. В основному поведінка наночастинок залежить від їх розміру, форми та активності взаємодії з навколишніми тканинами. Вони можуть спричинити" перевантаження" фагів (клітин, які ковтають і руйнують чужорідні речовини), що може спровокувати захисну лихоманку та знизити імунітет організму' Вони можуть накопичуватися в органах, оскільки вони не можуть погіршуватися або деградувати повільно. Іншим занепокоєнням є потенційна небезпека їх реакції на деякі біологічні процеси в організмі людини. Через велику площу поверхні наночастинки, що потрапляють у тканини та рідини, негайно адсорбують макромолекули, з якими вони стикаються. Це вплине, наприклад, на механізм регулювання ферментів та інших білків.