Високоемісійна рідка хроматографія (HPLC)

Хоча двовимірний гелевий електрофорез (2-DE) є загальноприйнятим методом для аналізу всього протеому, він має такі обмеження, як обмежена здатність до поділу, дискримінаційний ефект та складні операційні процедури. Часто буває важко отримати задовільні результати для аналізу великого динамічного діапазону, низької кількості і гідрофобних білків. Чонг та ін. використовували HPLC / мас-спектрометрію для порівняння та аналізу диференціальної експресії пре-злоякісних та ракових білків. Білок був розділений HPLC, і зібрані фракції були ідентифіковані MALDI-TOF-MS, так що білок був кількісно проаналізований в диференціальному вираженні двох видів клітин. Як новий тип технології поділу, багатовимірна рідка хроматографія не має обмеження відносної молекулярної маси та ізоелектричної точки. За допомогою поєднання різних режимів він усуває дискримінаційний ефект двовимірного гелевого електрофорезу. Має характеристики високої пікової потужності і простоти автоматизації. Двовимірна іонообмінно-зворотна фазова хроматографія (2D-IEC-RPLC) є найбільш часто використовуваною багатовимірною системою поділу рідинної хроматографії в дослідженнях протеоміки.